Η Ε.Μ.Ε. διεξάγει πανελλήνιους μαθηματικούς διαγωνισμούς στα μαθηματικά από το 1934. Από το 1985 διοργανώνει την Εθνική Μαθηματική Ολυμπιάδα. Με πρωτοβουλία της Ε.Μ.Ε. διοργανώνεται η Βαλκανική Μαθηματική Ολυμπιάδα, ενώ η Εταιρεία συμμετέχει κάθε χρόνο στη Διεθνή Μαθηματική Ολυμπιάδα.
